JBの影響かどうかわかりませんが、ある日iPod touch（4th 64GB iOS5.1 JB済み）のiTunesとの同期がうまく行かなくなり（一見うまく行っているように見える）、音楽ファイルが転送されなくなりました。プレイリストからドリルダウンで楽曲リストをみてみると、楽曲一覧がグレーアウトされています（キャプチャー画像なし...）。
そこで、とった対策は以下のとおり。
JBしているので、SSHでiPodにログインし、「/var/mobile/Media/iTunes_Control/iTunes」の「MediaLibrary.sqlitedb」を削除し、その後あらためて同期。すると、楽曲ファイルが復活し、再生できるようになりました。
異常の前触れとして、iPodをiTunesに接続した際に出てくる、空きや写真Appの容量を見るバー（同期ボタンの横）で、楽曲ファイルの領域が、黄色く「その他」と分類されていました。
